| Item type |
[ELS]紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) |
| 公開日 |
2017-02-20 |
| タイトル |
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タイトル |
アミロースのコンホメーション解析用コンピュータプログラム(農芸化学部門) |
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言語 |
ja |
| その他（別言語等） |
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その他のタイトル |
Computer programs for the conformational analysis of amylose (Agricultural Chemistry) |
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言語 |
en |
| 言語 |
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言語 |
jpn |
| 資源タイプ |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
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資源タイプ |
departmental bulletin paper |
| 著者 |
岡本, 高洋
中田, 靖
林, 武
恒川, 行康
北村, 進一
久下, 喬
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| 抄録(日) |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
アミロース鎖のコンホメーション解析のためのコンピュータプログラムをフォートラン言語で作成した。全体は, 6個の主プログラムから構成されている。その第Iのプログラムは, α-D-maltoseの原子座標をmaltose関連化合物の中性子線あるいはX線解析データから求めるためのものである。第IIのプログラムは, 半経験的なエネルギー関数を用いてα-D-maltoseのコンホメーションエネルギーを求めるためのものである。このプログラムは, エネルギーを等高線地図として表示する機能及び, 各コンホメーションの存在確立を求める機能を有している。第IIIのプログラムは, モンテカルロ法によって, 各コンホメーションの存在確立に従ってアミロース鎖を生成し, さらに生成アミロースのコンホメーションの特性を表わす各種パラメータを算出するためのものである。出力は, 分子鎖の末端間距離の分布を表わすヒストグラム及び, 特性比等である。代表的なモンテカルロ鎖のグラフィックディスプレイへの表示は, 他のプログラム(第Vのプログラム)を用いてなされる。第IVのプログラムは, 高分子統計力学を基礎とした解析的方法によって, 分子鎖のコンホメーションの平均を表わすパラメータを算出するものである。出力は, 特性比, 平均持続ベクトルの座標及び, 持続長等である。最後(第VI)のプログラムは, アミロース鎖の排除体積効果を計算するためのものである。効率的に摂動鎖を生成するために, WallとErpenbeckの方法を用いた。互いのプログラムは, オンラインで連続でき, データの再入力の必要がない様に設計されている。上記のプログラム群は, 他の多糖のコンホメーションの理論的解析に対しても応用できるものである。 |
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言語 |
ja |
| 抄録(英) |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
A series of computer programs in FORTRAN, which is made up six interrelated programs, was constructed to theoretically study the conformation of amylosic chain. The first program calculates conformational geometries of α-D-maltose using structural models based on the crystal structures of its related compounds. The second program estimates conformational energies of the α-maltose using semienpirical potential energy functions in the usual manner. The program involves the drawing of conformational energy contour map and the calculation of probability of conformations with respective conformational energies. The third program generates amylosic chains with various conformations so as to distributed consistent with the probability of respective conformations using a Monte Calro method, and estimates their average conformational properties. Outputs include the radial distribution function of end to end length and the average value of characteristic ratio. Perspective drawing of the representative Monte Calro chains can be performed using another program. The fourth program takes the statistical mechanical theory (ref. 2,6) to calculate the average conformational properties of amylosic chains. Outputs include characteristic ratios at given chain lengths, components of the persistence vector of vertual bond, and persistence length. The last program dials with the problem of the excluded volume effect in the amylosic chain sequence. The program takes the Wall-Erpenbeck s-p method (ref. 1) of chain enrichment. Programs can be run together without re-entry of data. Most of programs may be available for the theoretical investigation of other polysaccharides confomrmations. |
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言語 |
en |
| 書誌情報 |
ja : 京都府立大學學術報告. 農學
en : The scientific reports of Kyoto Prefectural University. Agriculture
巻 36,
p. 36-75,
発行日 1984-11-15
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| 雑誌書誌ID |
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収録物識別子タイプ |
NCID |
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収録物識別子 |
AN00062275 |
| ISSN |
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収録物識別子タイプ |
PISSN |
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収録物識別子 |
00757373 |
KJ00000079118.pdf (2.2 MB)
